在10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的基礎(chǔ)上,利用10x Feature Barcoding技術(shù)和Biolegend設(shè)計(jì)的帶有特異核酸序列的免疫組抗體(TotalSeq產(chǎn)品),可以同時(shí)獲得大量單個(gè)細(xì)胞中基因的表達(dá)量和細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)情況。在已知細(xì)胞表面標(biāo)志性蛋白時(shí),采用上述技術(shù)加入相應(yīng)抗體,能幫助我們更準(zhǔn)確的對(duì)細(xì)胞進(jìn)行功能研究。
圖1 Feature Barcoding技術(shù)結(jié)合TotalSeq抗體捕獲細(xì)胞表面蛋白原理圖
上圖左邊為BioLegend公司推出的TotalSeq系列抗體,每個(gè)抗體鏈接著一段設(shè)計(jì)好的核酸序列,序列上有每種抗體獨(dú)有的15 bp的barcode序列,通過(guò)抗原抗體特異性結(jié)合,帶有核酸序列的抗體會(huì)和細(xì)胞表面特定蛋白結(jié)合。之后通過(guò)右圖所示10x Genomics Feature Barcode技術(shù),可以捕獲到抗體所帶核酸序列,并通過(guò)UMI的數(shù)量,間接得到特定細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)量。實(shí)現(xiàn)了一套樣品進(jìn)行實(shí)驗(yàn)處理和信息分析,可同時(shí)得到基因表達(dá)信息和表面蛋白表達(dá)信息。