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真核有參/無參轉(zhuǎn)錄組

  • 產(chǎn)品簡介
  • 技術(shù)流程
  • 樣本要求
  • FAQ

轉(zhuǎn)錄組測序可以通過高通量測序平臺針對真核生物特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有mRNA進(jìn)行測序,快速檢測基因表達(dá)量、序列結(jié)構(gòu)及功能注釋信息,了解不同表型下基因表達(dá)的差異轉(zhuǎn)態(tài)。目前已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動植物發(fā)育調(diào)控、脅迫研究、遺傳進(jìn)化研究等方向。

產(chǎn)品優(yōu)勢
  • 經(jīng)驗(yàn)豐富
    提取成功率85%+,建庫成功率95%+,物種經(jīng)驗(yàn)100+,項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)10000+
  • 快速周期
    自動化操作體系,保證數(shù)據(jù)結(jié)果的同時(shí),實(shí)現(xiàn)快速交付
  • 組學(xué)分析
    支持以轉(zhuǎn)錄組為核心,聯(lián)合表觀,基因組、單細(xì)胞產(chǎn)品等多種分析策略
  • 一站式服務(wù)
    售前方案設(shè)計(jì),售中異常解決,售后個(gè)性化分析,多方位服務(wù)
產(chǎn)品特點(diǎn)
  • 應(yīng)用廣泛
    真核生物有參無參均可分析,覆蓋生物學(xué)、農(nóng)學(xué)等領(lǐng)域
  • 短平快
    技術(shù)成熟、周期快速、質(zhì)量可靠
  • 組學(xué)橋梁
    是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶,可以與上下游多種組學(xué)聯(lián)合分析
  • 分析豐富
    除基因表達(dá)及結(jié)構(gòu)分析外,對于檢測低豐度轉(zhuǎn)錄本和發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本具有其獨(dú)特的優(yōu)勢
產(chǎn)品類型測序平臺及策略推薦數(shù)據(jù)量周期
真核轉(zhuǎn)錄組測序

二代測序 PE150

有參:6/8/10 G clean data14天
無參:6/8/10 G clean data24天

產(chǎn)品類型樣品要求
真核轉(zhuǎn)錄組樣品需求量

≥0.3 μg

樣品濃度

≥30 ng/μl

樣品純度
OD260/280=1.8~2.2,OD260/230 除特別異常(負(fù)值 、超 2.5),不納入判定
RNA完整性

RIN≥4

           
  • Q:做轉(zhuǎn)錄組測序一般需要測多大數(shù)據(jù)量?
    A:
    轉(zhuǎn)錄組測序所需的測序量隨研究目的的不同而有所差異。目前,為保證數(shù)據(jù)分析結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性,推薦對有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組采用最低6 Gb clean data進(jìn)行后續(xù)分析,如果想檢測到低豐度的轉(zhuǎn)錄本推薦采用10 Gb clean data。如果沒有參考基因組,需要進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本的拼接組裝,為了拼接組裝的完整性,推薦10 Gb clean data的轉(zhuǎn)錄組測序。

  • Q:轉(zhuǎn)錄組測序的技術(shù)重復(fù)性很高,那是否還有必要設(shè)生物學(xué)重復(fù)?
    A:
    目前我們推薦至少設(shè)置3個(gè)及以上生物學(xué)重復(fù),5個(gè)以上的生物學(xué)重復(fù)更好。在樣本分析過程中,常會出現(xiàn)某個(gè)樣本離群導(dǎo)致生物學(xué)重復(fù)不足3個(gè)的情況,為了避免后期投稿過程中受到審稿人的質(zhì)疑,我們建議盡可能的多設(shè)置生物學(xué)重復(fù),增加差異基因的檢出率,減小整體假陽性率。

  • Q:無參轉(zhuǎn)錄組拼接注釋后,能得到的注釋基因有多少?
    A:
    注釋基因的多少跟所研究的物種直接相關(guān),如某些比較重要的物種基因研究的比較多,功能也比較清楚,注釋得到的基因就會很多,反之則會比較少。