ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing）是利用高通量測序檢測轉(zhuǎn)座酶易接近的染色質(zhì)的一門技術(shù)。ATAC-seq 只需要很少的細胞就能鑒定基因組中所有活躍的調(diào)控序列。在 ATAC-seq 技術(shù)中，利用轉(zhuǎn)座酶Tn5特異性識別并結(jié)合到開放染色質(zhì)區(qū)域的裸露DNA上，切割DNA的同時插入測序接頭，通過擴增形成完整文庫，上機測序、分析鑒定染色質(zhì)開放區(qū)域。
產(chǎn)品優(yōu)勢
- 低細胞起始量重復性好，信噪比高、特異性強、實驗簡單，耗時短
- 研究染色質(zhì)互作全景能同時揭示開放染色質(zhì)的基因組位置、DNA結(jié)合蛋白和轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點的相互作用
- 物種范圍廣滿足動物、植物等樣本的要求，具有很好的物種適應性
- 應用范圍廣適用于免疫機制、發(fā)育調(diào)控、抗逆脅迫等生物學研究
應用方向
- 繪制染色質(zhì)開放性圖譜，鑒定細胞/組織特異性調(diào)控元件和轉(zhuǎn)錄因子
- 表觀修飾差異研究，從轉(zhuǎn)錄調(diào)控揭示生物變異的表觀遺傳基礎(chǔ)
- 聯(lián)合多組學，建立轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡，打通基因組遺傳變異與生物表型關(guān)聯(lián)的“黑匣子”