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產品與服務
PRODUCTS & SERVICE

lncRNA

  • 產品簡介
  • 技術流程
  • 樣本要求
  • FAQ

長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA,位于細胞核或胞質內。lncRNA起初被認為轉錄的“噪音”,而后越來越多的研究表明,lncRNA 在眾多生命活動過程中發(fā)揮重要作用,lncRNA因此引起人們廣泛的關注。lncRNA測序技術也隨之廣泛應用于基因表達調控、物種進化、物質代謝以及環(huán)境抗逆等研究。

產品優(yōu)勢
  • 經驗豐富
    提取成功率85%+,建庫成功率95%+,物種覆蓋多,項目經驗2,000+
  • 實驗技術成熟
    采用官方建庫試劑盒,rRNA殘留率<10%,且穩(wěn)定
  • 專業(yè)的實驗/分析團隊
    實驗/分析團隊經驗豐富,其中生信人員平均專注轉錄調控領域5年+
  • 一站式服務
    售前方案設計,售中異常解決,售后個性化分析,多方位服務
產品特點
  • 可預測新的lncRNA
    既可鑒定已知的lncRNA,又可以預測新的lncRNA
  • 組學分析
    lncRNA+mRNA、lncRNA+miRNA、全轉錄組、lncRNA+表觀等
  • 三位一體
    三位一體的轉錄組分析解決方案(lncRNA-mRNA-circRNA)
應用領域
  • 環(huán)境脅迫
  • 轉錄調控
  • 分子標記
  • 生長發(fā)育等


產品類型測序平臺及策略推薦數據量數據質量
去核糖體鏈特異性文庫

二代測序 PE150

≥12 GQ30≥85%

產品類型樣品要求
lncRNA樣品需求量

動物樣品:≥0.5 μg

植物葉片、莖類樣品≥0.5 μg

樣品濃度

動物樣品:≥60 ng/μl

植物葉片、莖類樣品≥30 ng/μl

樣品純度
OD260/280=1.8~2.2
RNA完整性

植物樣品RIN≥5.5

動物樣品RIN≥5.8

   
  • Q:什么是長鏈非編碼RNA?以及它們的作用?
    A:
    哺乳動物基因組序列中約5%~10%被穩(wěn)定轉錄,蛋白質編碼基因僅約占1%,其余4%~9%的序列都轉錄為非編碼RNA。而非編碼RNA(non-coding RNA)是指不能翻譯為蛋白的功能性RNA分子。長鏈非編碼RNA為這4%~9%中長度大于200 nt的非編碼RNA。它們的作用主要體現在四個方面:第一,影響周邊基因的表達;第二,調控蛋白質活動及定位;第三,產生小分子RNA;第四,對其他RNA的調控作用。

  • Q:rRNA的去除方法有哪些?
    A:
    有些long non-coding RNA有polyA尾,有些沒有,為了保證能夠獲得所有l(wèi)ong non-coding RNA,就不能用oligodT標記磁珠進行富集,只能用去rRNA試劑盒去除核糖體RNA。不同物種rRNA去除效果跟試劑盒中所使用探針的匹配程度有很大相關,如果去除效果不好,需要加大測序數據量達到相應的clean data。

  • Q:long non-coding RNA為什么構建鏈特異性文庫?
    A:
    很多基因組區(qū)域具有正負鏈的轉錄本,反義轉錄是真核基因的一個特征,是一種重要的調控方式。使用ssRNA-Seq(Strand-Specific)能夠保留RNA的方向性信息,可以確定轉錄本來自正鏈還是負鏈,以便更加準確的獲得基因的結構以及基因表達信息。