Kinnex全長轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用 MAS-seq 方法，將 cDNA 分子串聯(lián)成長片段，串聯(lián)分子使用PacBio Revio平臺進(jìn)行測序，產(chǎn)生的 HiFi reads 經(jīng)過生物信息學(xué)拆分，即可還原原始 cDNA 序列。全長轉(zhuǎn)錄組測序，RNA分子無需打斷，測序可直接獲得完整序列。通過全長轉(zhuǎn)錄組測序能夠更準(zhǔn)確地得到轉(zhuǎn)錄本信息，可鑒定更多可變剪接位點(diǎn)、新基因和新的異構(gòu)體、融合基因等。
產(chǎn)品優(yōu)勢
- 高通量1張Revio cell可獲得高達(dá)40M+的高質(zhì)量HiFi reads
- 高準(zhǔn)確性數(shù)據(jù)準(zhǔn)確率高（～99.9%），無需短讀長測序數(shù)據(jù)糾錯
- 低成本Kinnex全長轉(zhuǎn)錄組方案可大幅提高測序通量，降低建庫測序成本
- 獲取完整全長轉(zhuǎn)錄組直接獲得的是5'-3'的全長Isoform，無需拼接，準(zhǔn)確性高
- 高準(zhǔn)確的結(jié)構(gòu)分析提供高精度的ORF預(yù)測和可變剪接點(diǎn)檢測，能夠識別新基因和新的可變剪接亞型
- 可拓展的定量分析近飽和的全長轉(zhuǎn)錄組測序可進(jìn)行基因/轉(zhuǎn)錄本定量分析
- 靈活的數(shù)據(jù)量選擇根據(jù)研究目的和研究樣本量，選擇單樣或混樣測序，滿足測序需求的同時降低批次效應(yīng)
應(yīng)用領(lǐng)域
- 揭示物種的轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性
- 輔助基因組注釋
- 探究不同處理?xiàng)l件下的轉(zhuǎn)錄本差異
- 不同時空、組織的轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)、功能特異性